More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4851 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  57.85 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  29.25 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.63 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  36.75 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.14 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  40.43 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.76 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.73 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.7 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  47.19 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  47.19 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  47.19 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.15 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.72 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.09 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  36.94 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.3 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28.78 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  41.05 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.36 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  34.01 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.33 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  27.6 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  28.85 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  27.6 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  49.23 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  29.89 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.06 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.79 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  51.92 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1996  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  23.19 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>