228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1327 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  89.6 
 
 		 203 aa  377  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  88.12 
 
 		 203 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  62.81 
 
 		 208 aa  267  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  60.2 
 
 		 208 aa  262  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  56.93 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  51.24 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 204 aa  244  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  55.28 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  55.31 
 
 		 181 aa  222  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  53.55 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 		 203 aa  214  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 202 aa  210  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  54.97 
 
 		 194 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  53.93 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  46.88 
 
 		 241 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  31.09 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  32.26 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  42.31 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.17 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  32.99 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  33.75 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  34.57 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.61 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  41.25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  37.1 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.04 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  23.89 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  23.89 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.7 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  32.91 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  27.19 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 230 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.04 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.61 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  32.59 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  42.42 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0525  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  40.96 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  30.43 
 
 		 96 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.12 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.3 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  29.27 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  29.92 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.76 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  32 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  32.98 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>