36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6032 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 171 aa  347  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  38.02 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 203 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 192 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 208 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 		 208 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  42.36 
 
 		 202 aa  120  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  32.12 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.66 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 222 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  27.01 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  47.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 		 246 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0462  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2930  isochorismatase hydrolase  38.6 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  30 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  43.1 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  40 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0484  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0917  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  35.56 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  27.61 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>