43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  48.39 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  43.48 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.88 
 
 		 180 aa  48.9  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.41 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  43.64 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  43.64 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  25.87 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 186 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 193 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  26.42 
 
 		 177 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  27.92 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>