259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1916 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  430  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  85.29 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  84.8 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  85.29 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  84.8 
 
 		 228 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  82.84 
 
 		 228 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 228 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  81.86 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 228 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  81.37 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  81.37 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  81.37 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  81.37 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  82.35 
 
 		 228 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  79.9 
 
 		 228 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  81.28 
 
 		 232 aa  358  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  80.79 
 
 		 232 aa  352  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  79.8 
 
 		 235 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  79.31 
 
 		 228 aa  348  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  79.31 
 
 		 228 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  79.31 
 
 		 228 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  77.83 
 
 		 234 aa  335  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  77.83 
 
 		 228 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  75.98 
 
 		 226 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  75.49 
 
 		 226 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  73.56 
 
 		 229 aa  313  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  72.95 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  73.3 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  70.67 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  67.48 
 
 		 229 aa  296  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  72.4 
 
 		 213 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  64.17 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  64.17 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  63.64 
 
 		 214 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  63.64 
 
 		 214 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  63.64 
 
 		 214 aa  254  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  63.1 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  63.1 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  59.36 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  61.5 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  59.47 
 
 		 216 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  58.95 
 
 		 216 aa  234  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  55.32 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  48.63 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  50.53 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  49.47 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  49.19 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  48.35 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  48.63 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  47.31 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  48.59 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  49.73 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  48.02 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  44.2 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  46.89 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  46.45 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  46.49 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  43.23 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  43.23 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  45.66 
 
 		 209 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  43.86 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  40.53 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  42.46 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  43.26 
 
 		 347 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  40.91 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  41.34 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  40.34 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  35.09 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  39.33 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  38.67 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  40.14 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  34.71 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  38.67 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  38 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>