223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4075 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  93.89 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  86.28 
 
 		 232 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  82.3 
 
 		 226 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  82.74 
 
 		 226 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  81.33 
 
 		 235 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  80.36 
 
 		 228 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  82.41 
 
 		 228 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  79.82 
 
 		 340 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  80 
 
 		 228 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  80.72 
 
 		 228 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  77.19 
 
 		 229 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  78.95 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  79.39 
 
 		 228 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  77.88 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  80.56 
 
 		 228 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  78.51 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  81.02 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  80.56 
 
 		 228 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  78.51 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  78.95 
 
 		 228 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  78.07 
 
 		 228 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  77.97 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  79.17 
 
 		 228 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  78.8 
 
 		 232 aa  358  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  75.88 
 
 		 228 aa  358  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  79.26 
 
 		 232 aa  358  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  73.56 
 
 		 204 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  67.43 
 
 		 213 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  64.19 
 
 		 216 aa  284  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  62.26 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  63.55 
 
 		 216 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  61.97 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  61.5 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  61.5 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  61.5 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  61.5 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  61.03 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  61.03 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  59.62 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  56.46 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  49.02 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  50.97 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 216 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  48.13 
 
 		 211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  48.51 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  48.79 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  49.51 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  47.29 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  48.54 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  48.53 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  48.78 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  45 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  44.65 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  47.34 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  44.5 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  42.23 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  39.91 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  41.58 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  41.58 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  41.55 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  42.36 
 
 		 347 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  39.8 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  38.61 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  37.37 
 
 		 206 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  34.34 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  34.65 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  32.99 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>