297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1435 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  73.81 
 
 
340 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  73.33 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  73.33 
 
 
228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  72.86 
 
 
228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  74.04 
 
 
228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  73.56 
 
 
228 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  72.86 
 
 
228 aa  324  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  71.9 
 
 
228 aa  321  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  73.56 
 
 
228 aa  320  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  70.48 
 
 
228 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  70.48 
 
 
228 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  71.15 
 
 
228 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  70 
 
 
228 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  70.48 
 
 
232 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  70.48 
 
 
228 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  70 
 
 
228 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  70 
 
 
228 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  69.52 
 
 
228 aa  314  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  69.52 
 
 
228 aa  314  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  69.52 
 
 
228 aa  314  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  69.52 
 
 
228 aa  314  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  69.71 
 
 
216 aa  313  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  70.89 
 
 
214 aa  313  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  71.15 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  70.89 
 
 
214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  70.89 
 
 
214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  70.89 
 
 
214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  70.19 
 
 
216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  70.89 
 
 
214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  68.57 
 
 
232 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  70.42 
 
 
214 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  70.42 
 
 
214 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  70.19 
 
 
235 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  69.71 
 
 
226 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  69.23 
 
 
226 aa  307  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  70.33 
 
 
217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  66.03 
 
 
216 aa  299  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  67.43 
 
 
229 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  72.4 
 
 
204 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  65.28 
 
 
235 aa  291  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  65.74 
 
 
229 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  65.88 
 
 
232 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  63.21 
 
 
229 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  62.69 
 
 
220 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  56.35 
 
 
211 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  54.55 
 
 
211 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  53.47 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  52.15 
 
 
221 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  52.94 
 
 
218 aa  227  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 
218 aa  222  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  51.01 
 
 
231 aa  221  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  52.74 
 
 
229 aa  221  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  48.77 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  51.02 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  51.24 
 
 
216 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 
216 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  48.51 
 
 
221 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 
217 aa  204  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  46.77 
 
 
218 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  50.26 
 
 
217 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  44.71 
 
 
208 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  47 
 
 
217 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  48.76 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  48.26 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  47.24 
 
 
217 aa  197  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  47.76 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  47.74 
 
 
213 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 
225 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  46.73 
 
 
213 aa  185  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  45.27 
 
 
217 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  44.22 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  46.23 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  46.46 
 
 
347 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  45.41 
 
 
212 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
212 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
212 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
212 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  41.36 
 
 
206 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 
207 aa  148  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  45.56 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  44.97 
 
 
209 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
209 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 
203 aa  144  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  44.38 
 
 
209 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  43.27 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  40.21 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  43.27 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  43.86 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  43.27 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  42.6 
 
 
215 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  43.27 
 
 
206 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 
203 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  43.2 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>