250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1914 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 232 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  95.24 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  87.22 
 
 		 228 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  86.78 
 
 		 228 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  86.78 
 
 		 228 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  87.22 
 
 		 228 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  86.34 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  86.34 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  86.34 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  85.46 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  85.46 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  85.46 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  85.46 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  84.14 
 
 		 228 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  84.14 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  83.7 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  81.94 
 
 		 228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  83.7 
 
 		 228 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  81.94 
 
 		 228 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  81.22 
 
 		 235 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  79.57 
 
 		 228 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  79.13 
 
 		 228 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  83.18 
 
 		 234 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  79.13 
 
 		 228 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  82.3 
 
 		 226 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  82.78 
 
 		 226 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  78.8 
 
 		 229 aa  358  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  81.28 
 
 		 204 aa  358  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 		 235 aa  357  6e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  78.77 
 
 		 232 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  76.74 
 
 		 229 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  73.15 
 
 		 229 aa  344  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  70.48 
 
 		 213 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  61.61 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  61.14 
 
 		 214 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  59.81 
 
 		 216 aa  274  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  62.09 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  60.66 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  60.66 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  60.66 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  59.81 
 
 		 216 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  60.19 
 
 		 214 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  60.19 
 
 		 214 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  60.98 
 
 		 217 aa  264  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  56.46 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  51.01 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  47.5 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  48.06 
 
 		 211 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  47.74 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  49.25 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  49.25 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  46.53 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  49.25 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  46.26 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  46.5 
 
 		 218 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  47.5 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  45.59 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  43.87 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  43.84 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  41.83 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  43.98 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  45 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  42.51 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  45.05 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  43.98 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  43.88 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  41.87 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  42.64 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  42.5 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  39.41 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  40.39 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  40.61 
 
 		 212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  42.21 
 
 		 347 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  35.94 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  38.36 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  35.86 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  35.35 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 211 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  37.79 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 		 206 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  36.11 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>