275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1179 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  77.32 
 
 		 203 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  40.1 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 		 228 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  38.5 
 
 		 340 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  38 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  38 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  36.82 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  38.46 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  38.46 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  37.95 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 232 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  37.95 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  37.95 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  37.95 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  37.95 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  37 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  35.71 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  34.33 
 
 		 235 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  35.2 
 
 		 226 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 228 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  39.59 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  38.02 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  34.72 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  37.56 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  35.18 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  36.17 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  33.86 
 
 		 211 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  32.32 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  32.82 
 
 		 347 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  29.21 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  30.16 
 
 		 226 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  30.16 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  30.05 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  29.56 
 
 		 226 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  29.56 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  29.56 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  29.56 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  30.05 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>