258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  100 
 
 
226 aa  466  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  99.12 
 
 
226 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  85.09 
 
 
229 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  85.33 
 
 
226 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  80.89 
 
 
225 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  82.22 
 
 
225 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  80.44 
 
 
226 aa  380  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  80.44 
 
 
226 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  79.56 
 
 
226 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  79.11 
 
 
226 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  79.11 
 
 
226 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  79.11 
 
 
226 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  78.67 
 
 
226 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  79.11 
 
 
226 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  78.67 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  78.67 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  78.67 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  78.67 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  78.67 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  45.27 
 
 
206 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  45.18 
 
 
208 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  45.18 
 
 
208 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  45.27 
 
 
206 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  45.27 
 
 
206 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 
208 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  45.27 
 
 
206 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 
208 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  46.77 
 
 
214 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  46.77 
 
 
214 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  46.77 
 
 
214 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  46.77 
 
 
211 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  46.19 
 
 
205 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
208 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  45.69 
 
 
205 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  44.67 
 
 
210 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  46.27 
 
 
214 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 
208 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  44.28 
 
 
208 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  46.27 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  43.27 
 
 
210 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  45.92 
 
 
209 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  45.5 
 
 
215 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
209 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  45.27 
 
 
214 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
209 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  45.41 
 
 
208 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  45.41 
 
 
208 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  45.5 
 
 
207 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  45.27 
 
 
209 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 
208 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  44.9 
 
 
208 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 
208 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  44.9 
 
 
208 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 
208 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  45.92 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  45.77 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 
204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  43.46 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  45.92 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  44.9 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  43.19 
 
 
215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 
208 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 
208 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 
224 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  40.43 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  36.92 
 
 
201 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 
201 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  47.65 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 
250 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4259  isochorismatase hydrolase  64.08 
 
 
124 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  40.37 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
213 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
216 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 
229 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  38.73 
 
 
214 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  38.73 
 
 
214 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  38.73 
 
 
214 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  38.73 
 
 
214 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
211 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
231 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  38.73 
 
 
214 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 
208 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  38.73 
 
 
214 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  38.67 
 
 
209 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
216 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  38.15 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  36.36 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  37.79 
 
 
217 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
211 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 
218 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>