217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1666 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  93.89 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  84.51 
 
 
232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  81.86 
 
 
226 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  81.42 
 
 
226 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  78.67 
 
 
235 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  78.57 
 
 
228 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 
228 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  77.43 
 
 
234 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  78.92 
 
 
228 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  77.19 
 
 
229 aa  363  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  77.63 
 
 
284 aa  363  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  78.07 
 
 
228 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  77.63 
 
 
340 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  80.37 
 
 
228 aa  362  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  76.75 
 
 
228 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  76.32 
 
 
228 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  76.32 
 
 
228 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  75.88 
 
 
228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  75.33 
 
 
235 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  75.88 
 
 
228 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  76.32 
 
 
228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  75.88 
 
 
228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  76.32 
 
 
228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  76.32 
 
 
228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  75.88 
 
 
228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  76.32 
 
 
228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  77.1 
 
 
228 aa  348  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  77.21 
 
 
232 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  76.74 
 
 
232 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  73.25 
 
 
228 aa  344  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  70.67 
 
 
204 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  65.74 
 
 
213 aa  291  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  62.62 
 
 
216 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  61.79 
 
 
216 aa  275  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  62.62 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  61.03 
 
 
214 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  60.56 
 
 
214 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  60.56 
 
 
214 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  60.56 
 
 
214 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  60.56 
 
 
214 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  60.09 
 
 
214 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  60.09 
 
 
214 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  60.09 
 
 
217 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  56.59 
 
 
220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  49.52 
 
 
218 aa  207  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  48.28 
 
 
231 aa  200  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  49.76 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  49.01 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  47.57 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  49.52 
 
 
218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  49.03 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  49.51 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 
221 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  49.29 
 
 
217 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  49.52 
 
 
217 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  47.57 
 
 
225 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  41.31 
 
 
208 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  47.14 
 
 
218 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  43 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  43.41 
 
 
218 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  40.78 
 
 
217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  42.5 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 
217 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 
217 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 
217 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  41.55 
 
 
213 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  42.16 
 
 
213 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  41.87 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 
213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  39.8 
 
 
212 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 
212 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
203 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  36.87 
 
 
206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  37.07 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 
209 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
211 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
207 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  32.32 
 
 
209 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 
209 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 
209 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  32.67 
 
 
209 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
209 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
209 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 
215 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 
208 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 
206 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  33.16 
 
 
206 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  33 
 
 
208 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
206 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
208 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  32.62 
 
 
208 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>