More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2389 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 211 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  91.47 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  82.94 
 
 		 211 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  65.87 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  65.87 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  65.09 
 
 		 216 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  53.33 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 		 220 aa  237  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  54.55 
 
 		 213 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  53.17 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  51.92 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  52.28 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  52.28 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  50.76 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  50.76 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  50.76 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  50.76 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  50.76 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  50.76 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  52.28 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  50.25 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  50.74 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  52.45 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  50.99 
 
 		 231 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  51.24 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  51.98 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  51.49 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  51.49 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  49.03 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  52.17 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  51.52 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  51.01 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  49.03 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  51.01 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  49.03 
 
 		 284 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  51.52 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  49.51 
 
 		 340 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  51.01 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  51.52 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  51.52 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  51.52 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  51.52 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  48.08 
 
 		 234 aa  205  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  48.54 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  50.51 
 
 		 228 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  48.06 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  49.49 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  48.54 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  48.13 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  49.51 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  49.28 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  47.69 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  45.41 
 
 		 218 aa  195  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  45.75 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  49.47 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  46.31 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  47.42 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  47.42 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  45.23 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  46.39 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  43.96 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  42 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  45.36 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  44.78 
 
 		 347 aa  174  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  42.08 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  41.09 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  40.7 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  39.79 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  37.77 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  38.46 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  37.91 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  37.85 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  39.05 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  39.05 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  37.3 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  39.05 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  36.76 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  38.46 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>