More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0229 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  98.08 
 
 
208 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  98.08 
 
 
208 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  93.75 
 
 
210 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  89.42 
 
 
208 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  85.58 
 
 
208 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  78.74 
 
 
209 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  78.74 
 
 
209 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  80.81 
 
 
204 aa  343  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  78.26 
 
 
209 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  79.8 
 
 
205 aa  339  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  77.78 
 
 
209 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  78.61 
 
 
206 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  77.78 
 
 
209 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  78.61 
 
 
206 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  77.78 
 
 
209 aa  338  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  77.78 
 
 
209 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  76.85 
 
 
208 aa  339  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  76.21 
 
 
210 aa  338  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  75.48 
 
 
208 aa  338  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  75.48 
 
 
208 aa  338  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  74.4 
 
 
208 aa  337  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  78.11 
 
 
206 aa  337  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  77.11 
 
 
206 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  75.96 
 
 
208 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  78.28 
 
 
205 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  75 
 
 
208 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  74.52 
 
 
208 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  74.52 
 
 
208 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  74.52 
 
 
208 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  74.52 
 
 
208 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 
208 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  73.56 
 
 
207 aa  330  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  75.25 
 
 
208 aa  325  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  72.33 
 
 
208 aa  325  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  73.66 
 
 
215 aa  321  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  77.89 
 
 
215 aa  318  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  71.98 
 
 
211 aa  318  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  71.72 
 
 
214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  71.72 
 
 
214 aa  302  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  71.21 
 
 
214 aa  299  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  71.21 
 
 
214 aa  299  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  71.21 
 
 
214 aa  299  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  70.71 
 
 
211 aa  298  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  70.71 
 
 
214 aa  297  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  70.2 
 
 
214 aa  297  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  66.17 
 
 
224 aa  288  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  47.18 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  44.28 
 
 
226 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  45.13 
 
 
226 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  44.28 
 
 
226 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  46.43 
 
 
226 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  47.18 
 
 
226 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 
225 aa  191  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  45.64 
 
 
225 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  48.47 
 
 
225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  48.47 
 
 
225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  48.47 
 
 
225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  48.47 
 
 
225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  48.47 
 
 
225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  47.69 
 
 
226 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  47.69 
 
 
226 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  47.69 
 
 
226 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  47.69 
 
 
226 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  46.67 
 
 
226 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  44.55 
 
 
224 aa  185  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  45.66 
 
 
210 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  46.27 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  47.93 
 
 
217 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  37.81 
 
 
225 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0070  isochorismatase hydrolase  66.99 
 
 
137 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 
250 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  43.55 
 
 
217 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  43.01 
 
 
217 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
216 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  41.07 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  41.07 
 
 
196 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 
218 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
201 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 
191 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  41.34 
 
 
209 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  43.2 
 
 
217 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  40.94 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 
211 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  40.83 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
211 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  39.18 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  37.65 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  39.18 
 
 
214 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5362  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
228 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  39.18 
 
 
214 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  39.18 
 
 
214 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  39.18 
 
 
214 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  39.18 
 
 
214 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>