More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3570 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  85.78 
 
 		 205 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  85.29 
 
 		 205 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  80.39 
 
 		 208 aa  353  6.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  80.81 
 
 		 208 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  80.81 
 
 		 208 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  80.81 
 
 		 208 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  79.9 
 
 		 210 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  84.16 
 
 		 215 aa  337  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  77.61 
 
 		 209 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  77.61 
 
 		 209 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  78.28 
 
 		 208 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  77.11 
 
 		 209 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  77.11 
 
 		 209 aa  333  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  77.5 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  77.5 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  78.39 
 
 		 208 aa  332  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  77 
 
 		 209 aa  330  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  75.62 
 
 		 207 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  73.4 
 
 		 206 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  73.4 
 
 		 206 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  73.4 
 
 		 206 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  72.91 
 
 		 206 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  74.26 
 
 		 208 aa  323  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  73.27 
 
 		 208 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  73.63 
 
 		 208 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  73.63 
 
 		 208 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  74.75 
 
 		 211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  74.75 
 
 		 214 aa  317  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  72.64 
 
 		 208 aa  317  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  72.64 
 
 		 208 aa  317  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  73.13 
 
 		 208 aa  317  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  72.64 
 
 		 208 aa  317  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  72.64 
 
 		 208 aa  317  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  74.75 
 
 		 214 aa  316  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  71.86 
 
 		 210 aa  316  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  72.64 
 
 		 208 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  70.79 
 
 		 208 aa  313  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  74.26 
 
 		 214 aa  313  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  74.26 
 
 		 214 aa  313  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  74.26 
 
 		 214 aa  313  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  72.77 
 
 		 215 aa  313  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  71.29 
 
 		 208 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  73.27 
 
 		 214 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  73.76 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  72.64 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  65.66 
 
 		 224 aa  278  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 		 224 aa  201  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  47.21 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  47.21 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  47.21 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  47.21 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  45.13 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  44.83 
 
 		 225 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  44.67 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  42.93 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  42.93 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  45.13 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  45.69 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  44.1 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  46.7 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  46.7 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  46.7 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  46.7 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  46.7 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  48.5 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  46.34 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0070  isochorismatase hydrolase  69.61 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  44.38 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  42.77 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  41.48 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  43.2 
 
 		 196 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  41.48 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  42.35 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  42.01 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  37.77 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  40.83 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  37.63 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  37.63 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  37.63 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  37.63 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  37.63 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  37.63 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  37.63 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  38.01 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  39.77 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>