198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3207 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  43.84 
 
 
224 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
204 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  40.8 
 
 
208 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  43.92 
 
 
215 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  43.6 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  43.6 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  38.68 
 
 
205 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  44.19 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  42.22 
 
 
205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  41.86 
 
 
214 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  41.44 
 
 
209 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
209 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  41.99 
 
 
209 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
209 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 
209 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 
208 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  41.99 
 
 
209 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  43.35 
 
 
207 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  41.28 
 
 
214 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  41.86 
 
 
214 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
208 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  40.88 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  36.95 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  34.91 
 
 
210 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  40.56 
 
 
206 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
206 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  41.34 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  40.7 
 
 
214 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  40.7 
 
 
214 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 
211 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  40.7 
 
 
214 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 
211 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  41.86 
 
 
208 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  40.12 
 
 
214 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  37.24 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  37.24 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  34.12 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  37.24 
 
 
208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  37.24 
 
 
208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  34.12 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 
208 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 
226 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  36.73 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
226 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
226 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  35.86 
 
 
225 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  35.86 
 
 
225 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  35.86 
 
 
225 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  35.86 
 
 
225 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  35.86 
 
 
225 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  34.63 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
216 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
211 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 
196 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  32.85 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  32.85 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  32.85 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  32.85 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  32.37 
 
 
226 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
211 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
211 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
216 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 
204 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 
218 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  36 
 
 
216 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 
213 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  35.2 
 
 
214 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  35.2 
 
 
214 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  35.2 
 
 
214 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  35.2 
 
 
214 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
217 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
228 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5362  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 
228 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
228 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
216 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  35.2 
 
 
214 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  35.2 
 
 
214 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  32.82 
 
 
228 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
201 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
216 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  34.09 
 
 
228 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  34.69 
 
 
214 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  34.86 
 
 
209 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>