240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2524 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  89.05 
 
 		 201 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 196 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  60.64 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5362  isochorismatase hydrolase  63.68 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  41.9 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  41.57 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  41.34 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  44.97 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  37.11 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 229 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  37.11 
 
 		 226 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  41.71 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  41.71 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  40.91 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  40.78 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  40.34 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  41.14 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  39.77 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  40.91 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  40.57 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  41.71 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  40.57 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  40 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  38.64 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  37.5 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  37.5 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  37.5 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  37.5 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  36.93 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  36.93 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  39.77 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  40.59 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  40.59 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  39.77 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  40.59 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  40.59 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  40.59 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  39.77 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  39.77 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  39.05 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  36.93 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  38.64 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  38.95 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  34.71 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  37.72 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  37.72 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  36.21 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  31.76 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  31.76 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>