More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1001 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
208 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  87.75 
 
 
206 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  88.24 
 
 
206 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  86.06 
 
 
208 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  86.06 
 
 
208 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  85.1 
 
 
208 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  85.1 
 
 
208 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  87.25 
 
 
206 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  85.1 
 
 
208 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  87.75 
 
 
206 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  85.1 
 
 
208 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  84.13 
 
 
208 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  85.58 
 
 
208 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  84.47 
 
 
207 aa  370  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  82.69 
 
 
208 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  85.78 
 
 
209 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  85.78 
 
 
209 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  85.29 
 
 
209 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  80.19 
 
 
208 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  84.31 
 
 
209 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  82.84 
 
 
209 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  82.84 
 
 
209 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  82.84 
 
 
209 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  79.81 
 
 
208 aa  351  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  77.83 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  77.83 
 
 
208 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  78.43 
 
 
215 aa  340  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  76.47 
 
 
210 aa  339  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  76.85 
 
 
208 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 
210 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  75.86 
 
 
205 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  75.37 
 
 
205 aa  331  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  75.74 
 
 
208 aa  330  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  74.26 
 
 
208 aa  328  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  74.26 
 
 
204 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  73.27 
 
 
208 aa  322  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  72.33 
 
 
211 aa  318  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  76.73 
 
 
215 aa  315  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  68.32 
 
 
211 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  67.33 
 
 
214 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  64.04 
 
 
224 aa  281  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  67.33 
 
 
214 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  66.83 
 
 
214 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  66.83 
 
 
214 aa  278  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  66.83 
 
 
214 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  66.83 
 
 
214 aa  277  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  65.84 
 
 
214 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  44.39 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 
224 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  44.1 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  44.9 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  41.62 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  45.41 
 
 
226 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  41.62 
 
 
226 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  45.41 
 
 
226 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  45.41 
 
 
226 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  45.41 
 
 
226 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  44.1 
 
 
226 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  43.08 
 
 
225 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  45.41 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  45.41 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  45.41 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  45.41 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  45.41 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  42.79 
 
 
225 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  41.84 
 
 
229 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  44.85 
 
 
210 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  47.74 
 
 
207 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0070  isochorismatase hydrolase  71.57 
 
 
137 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 
225 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 
196 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  46.75 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  43.86 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
201 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  42.7 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  44.38 
 
 
217 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  41.42 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  40.36 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  42.16 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  41.08 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  41.38 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  41.38 
 
 
214 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  41.38 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  41.38 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  41.38 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  41.38 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  40.91 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  41.38 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  41.42 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  37.3 
 
 
211 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  41.95 
 
 
217 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 
211 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
218 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>