214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0905 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  54.07 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  48.48 
 
 		 205 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  48.47 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  46.57 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5255  isochorismatase superfamily hydrolase  47.06 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5165  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0378117  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  46.08 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  48.45 
 
 		 208 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  51.16 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5303  isochorismatase hydrolase  47.74 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  47 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  46.86 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  47.24 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  47.24 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  47.94 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  47.94 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  47.94 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  47.94 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  47.42 
 
 		 208 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  47.42 
 
 		 208 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  45.32 
 
 		 208 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  45.32 
 
 		 208 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5307  isochorismatase hydrolase  46.5 
 
 		 209 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  46.04 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  46.04 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  45.5 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3987  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  45.77 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  44.55 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  45.1 
 
 		 208 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  46.91 
 
 		 208 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  45.18 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  49.73 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  49.2 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  49.2 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  49.2 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  49.2 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  48.13 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  48.66 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5033  isochorismatase hydrolase  51.16 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  43.84 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  41.78 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  39.91 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  41.78 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  40.38 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  40.38 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  40.69 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  40.69 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1926  isochorismatase hydrolase  43.98 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  46.11 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1924  isochorismatase hydrolase  43.93 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  40.19 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  40.19 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  40.19 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  40.19 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  40.19 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  38.97 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  38.97 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  38.97 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  38.97 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  38.03 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1274  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0253  isochorismatase hydrolase  39.41 
 
 		 204 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  38.71 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  34.02 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4723  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 191 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07202  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03270)  35.03 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  40.34 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  38.07 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2524  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  36.04 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  39.2 
 
 		 347 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  36.92 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  36.92 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  36.08 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  36.08 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  36.08 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  36.08 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>