167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2040 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
174 aa  357  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  48.81 
 
 
170 aa  168  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  44.89 
 
 
181 aa  153  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0207  conserved hypothetical protein, putative amidase  36.26 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0154  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.81 
 
 
173 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0745833  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0126  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  30.81 
 
 
173 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.357919  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0114  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.81 
 
 
173 aa  101  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  31.64 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  29.93 
 
 
211 aa  57.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
182 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  26.15 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  28.26 
 
 
201 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
201 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.57 
 
 
227 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.01 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  29.28 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  30.56 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 
234 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  29.28 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  26.28 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  29.2 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  27.93 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  26.28 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.49 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.77 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  28.73 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.88 
 
 
209 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  26.55 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.87 
 
 
207 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
174 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
201 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  27.91 
 
 
215 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 
222 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.12 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  26.73 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  26.57 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.88 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  23.94 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  25.99 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  25 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  24.53 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  24.53 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  24.62 
 
 
192 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.41 
 
 
212 aa  48.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  26.4 
 
 
240 aa  48.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  23.44 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
221 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  25.26 
 
 
199 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  26.29 
 
 
193 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  25 
 
 
231 aa  47.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
200 aa  47.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.8 
 
 
213 aa  47.4  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  27.5 
 
 
200 aa  47.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
189 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  26.37 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  26.56 
 
 
238 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  25.79 
 
 
199 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  26.97 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 
193 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  27.43 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  24.32 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  23.04 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  26.67 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.12 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  26 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  32.98 
 
 
213 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  25.99 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  24.86 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.32 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 
234 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  26.58 
 
 
201 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>