More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1242 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  67.76 
 
 		 183 aa  265  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  67.4 
 
 		 182 aa  261  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  67.4 
 
 		 182 aa  261  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  66.85 
 
 		 182 aa  261  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  66.85 
 
 		 182 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  66.85 
 
 		 182 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  65.75 
 
 		 182 aa  258  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  66.85 
 
 		 182 aa  258  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 183 aa  257  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  65.75 
 
 		 182 aa  257  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  56.04 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  55.19 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  56.83 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  51.65 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  54.95 
 
 		 181 aa  204  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  53.07 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  53.07 
 
 		 186 aa  197  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  51.1 
 
 		 184 aa  193  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  44.2 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  72.28 
 
 		 102 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  34.83 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.53 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.14 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  33.16 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  28.8 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  28.49 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  30.57 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.05 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.05 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 289 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  32.43 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  31.52 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  30.94 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  44.29 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.52 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  30.85 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  28.72 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  34.48 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0030  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  30.48 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  28.72 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  26.78 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  34.31 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  44.74 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.11 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.23 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  29.51 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  28.19 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  35.09 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.75 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  36.99 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.72 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>