295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1355 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  72.16 
 
 		 203 aa  280  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  48.92 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  45.16 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  44.15 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  44.04 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.31 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  41.15 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  41.15 
 
 		 210 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  42.16 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.12 
 
 		 212 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.81 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  39 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  39 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.5 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  39.76 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  41.18 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.69 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  34.48 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  38.92 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  38.42 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.95 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.95 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.45 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.95 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  36.95 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.27 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.95 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.95 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  36.95 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  40.8 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  37.89 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.28 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.45 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  38.12 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  39.6 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  37.13 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  40.1 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  35.96 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  40.19 
 
 		 212 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  36.45 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  37.25 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  38.05 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  38.97 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.29 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  37.56 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  36.27 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  40.94 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  38.12 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  39.43 
 
 		 179 aa  98.6  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.76 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  39.79 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  36.63 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  38.12 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  39.13 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  38.12 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.13 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  37 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  39.27 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.13 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  36.36 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.11 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.13 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  36.97 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  37 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  37 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  37 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  38.42 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  40.7 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.59 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  37 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.59 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.59 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.59 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  39.89 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.82 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.12 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  39.67 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  39.34 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  39.8 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  36.84 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  39.01 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.76 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  37.04 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>