89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0207 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0207  conserved hypothetical protein, putative amidase  100 
 
 		 170 aa  348  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0114  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  59.54 
 
 		 173 aa  220  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0154  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  58.96 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0745833  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0126  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  58.96 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.357919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  40.8 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  39.18 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  30.91 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  30.91 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  30.3 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  32.32 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  29.7 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  25.29 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  23.5 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  24.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  23.56 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  22.51 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  28.48 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  28.48 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  24.71 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  27.91 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  28.48 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  24.61 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  26.56 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  25.97 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  20.9 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  27.11 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.22 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  22.34 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  23.16 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  23.78 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.78 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  22.84 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  21.79 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  26.15 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.14 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  21.83 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  20.71 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  25.58 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  25 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  28.48 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  23.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  21.83 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  30 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  24.06 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  23.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  23.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  23.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  24.61 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  21.83 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  21.89 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  23.5 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  21.83 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 		 180 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 186 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 186 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  25.5 
 
 		 208 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  22.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  31.25 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  23.62 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  23.12 
 
 		 214 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>