More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2374 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  69.79 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  65.31 
 
 		 206 aa  254  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 191 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  67.58 
 
 		 186 aa  247  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  66.32 
 
 		 190 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  64.86 
 
 		 184 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  63.68 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  61.06 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  56.77 
 
 		 193 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  66.48 
 
 		 184 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  66.48 
 
 		 184 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  66.48 
 
 		 184 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  66.32 
 
 		 189 aa  228  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  62.84 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  68.42 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  59.38 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  58.51 
 
 		 194 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  55.07 
 
 		 207 aa  214  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  63.44 
 
 		 195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  62.3 
 
 		 190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  55.22 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  65 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  55.14 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  53.68 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  48.9 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  49.73 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  49.2 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  43.89 
 
 		 227 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  46 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  50 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  48.85 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  52.04 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  43.3 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  41.79 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.79 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  42.93 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  40.32 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  39.47 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.54 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  36.32 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  38.54 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.31 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.55 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  39.18 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.79 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  36.1 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.79 
 
 		 215 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.86 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.65 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.6 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  36.65 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.6 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  42.13 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.16 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.18 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  33.18 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  37.63 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  33 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  36.82 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.16 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  35.96 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  39.43 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  36.22 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  34.15 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.36 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.95 
 
 		 218 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  33.33 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  38.65 
 
 		 238 aa  97.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.02 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.02 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.02 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.02 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  32.84 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  34.15 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.49 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  35.92 
 
 		 240 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  32.04 
 
 		 221 aa  95.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  33.84 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  36.87 
 
 		 237 aa  94.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  30.54 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.57 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.82 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  35.91 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>