More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1519 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  67.37 
 
 
192 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  66.32 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  63.16 
 
 
193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  63.98 
 
 
191 aa  230  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  60.82 
 
 
206 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  64.74 
 
 
193 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  60.39 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  61.9 
 
 
194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  66.48 
 
 
184 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  66.48 
 
 
184 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  66.48 
 
 
184 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  64.74 
 
 
190 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  62.64 
 
 
186 aa  208  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  60.75 
 
 
184 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  68.06 
 
 
189 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  58.24 
 
 
201 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  57.3 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  53.85 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  61.05 
 
 
190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  52.07 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  62.23 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  58.79 
 
 
190 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  64.32 
 
 
186 aa  185  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  51.26 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  52.46 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  51.87 
 
 
207 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  45.95 
 
 
227 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  51.37 
 
 
194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  46.04 
 
 
204 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 
194 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  48.65 
 
 
204 aa  150  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  44.27 
 
 
192 aa  140  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  44.06 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  51.78 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.81 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  40.2 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  35.15 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  38.19 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  36.95 
 
 
210 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.82 
 
 
213 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.82 
 
 
213 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  35.96 
 
 
201 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.82 
 
 
213 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  42.86 
 
 
201 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.47 
 
 
213 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.32 
 
 
213 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.82 
 
 
213 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  35.82 
 
 
213 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.37 
 
 
209 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  35.82 
 
 
213 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.82 
 
 
213 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  33.99 
 
 
202 aa  105  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  37.93 
 
 
199 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  38.68 
 
 
198 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  39.46 
 
 
201 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 
193 aa  104  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.15 
 
 
210 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  38.46 
 
 
201 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.46 
 
 
209 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.44 
 
 
201 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.59 
 
 
213 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.78 
 
 
212 aa  101  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.82 
 
 
215 aa  101  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  41.4 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.5 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.82 
 
 
218 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.82 
 
 
218 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.92 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.92 
 
 
215 aa  97.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.02 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.82 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.92 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.96 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  33.01 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.32 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  41.77 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  31.4 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  31.37 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  35.75 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  38 
 
 
206 aa  94.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  37.44 
 
 
238 aa  94  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  32.52 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  36.23 
 
 
213 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  35.75 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.98 
 
 
215 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
195 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
211 aa  92  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  36.73 
 
 
237 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  37.1 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  35.47 
 
 
221 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  34.01 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  34.98 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>