More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1096 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  87.05 
 
 		 193 aa  323  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  61.98 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  56.77 
 
 		 192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  61.5 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  60.42 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  55.15 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  57 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  63.16 
 
 		 189 aa  214  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.64 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  62.98 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  61.08 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  55.32 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  53.68 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  55.31 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  54.59 
 
 		 184 aa  198  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  54.89 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  51.23 
 
 		 216 aa  194  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  53.26 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  53.85 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  55.79 
 
 		 189 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  48.77 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  47.8 
 
 		 191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  44.04 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  45.16 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  45.74 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  48.33 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  40.2 
 
 		 204 aa  150  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  40.72 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  44.51 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  49.73 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  38 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  37.19 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  40.2 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.19 
 
 		 210 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  40 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  38.19 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.41 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.82 
 
 		 212 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  35.92 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  41.11 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  37.76 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.06 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.18 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.18 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.92 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.18 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  34.5 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.12 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  36.5 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.5 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  39.39 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  40.83 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  36.46 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.56 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  35.14 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.83 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  36.19 
 
 		 221 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  31.19 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.85 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  36.08 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  36.18 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  36.82 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  37.57 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  37.22 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  36.32 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 		 218 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  38.27 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  34.93 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  37.88 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  40 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  38.89 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  33.5 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  37.07 
 
 		 238 aa  97.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  40.35 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  34.48 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  37.43 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  37.23 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  35.44 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>