294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1406 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  75.47 
 
 
221 aa  334  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  74.26 
 
 
208 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  69.86 
 
 
210 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  75.5 
 
 
210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  75 
 
 
210 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  76.38 
 
 
210 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  69.34 
 
 
213 aa  304  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.72 
 
 
212 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.72 
 
 
212 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  75 
 
 
210 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.72 
 
 
212 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  75.88 
 
 
210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  75.88 
 
 
210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.23 
 
 
212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.23 
 
 
212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.23 
 
 
212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.23 
 
 
212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  68.4 
 
 
213 aa  300  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  77.61 
 
 
212 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  75.13 
 
 
210 aa  285  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  65.7 
 
 
225 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  61.35 
 
 
237 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  61.54 
 
 
208 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  59.9 
 
 
240 aa  271  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  65.22 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  67.16 
 
 
210 aa  271  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.78 
 
 
216 aa  269  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  59.42 
 
 
240 aa  269  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  59.62 
 
 
214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  63.32 
 
 
208 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  64.39 
 
 
210 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  66.67 
 
 
208 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  61 
 
 
248 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  62.76 
 
 
203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  59.2 
 
 
210 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  63.86 
 
 
207 aa  256  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  62.94 
 
 
207 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  60.1 
 
 
201 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  61.03 
 
 
199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  61.34 
 
 
209 aa  240  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  62 
 
 
201 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  63.27 
 
 
203 aa  234  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  57.73 
 
 
209 aa  231  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  58.79 
 
 
201 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  53.61 
 
 
202 aa  228  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.29 
 
 
201 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  56.7 
 
 
209 aa  225  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  56.77 
 
 
200 aa  222  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  55.67 
 
 
197 aa  221  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  56.25 
 
 
201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  59.16 
 
 
198 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  52.31 
 
 
238 aa  203  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1593  isochorismatase hydrolase  48.53 
 
 
210 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  45.77 
 
 
206 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  51.74 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  45.27 
 
 
206 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  49.25 
 
 
205 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  49.01 
 
 
206 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  52.43 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  50.72 
 
 
213 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  54.19 
 
 
217 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  49.53 
 
 
213 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
196 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  47.43 
 
 
179 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  44.72 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  53.63 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  50.5 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  50.56 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  44.61 
 
 
208 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  45.1 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  48.26 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  44.61 
 
 
208 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.41 
 
 
215 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.41 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.41 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  48.65 
 
 
208 aa  161  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.93 
 
 
213 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  43.48 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  50 
 
 
215 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  47.03 
 
 
208 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  39.81 
 
 
208 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.13 
 
 
213 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.13 
 
 
213 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.13 
 
 
213 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.06 
 
 
213 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.13 
 
 
213 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  42.13 
 
 
213 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  42.13 
 
 
213 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.13 
 
 
213 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.67 
 
 
213 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.71 
 
 
212 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  46.41 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.23 
 
 
210 aa  151  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.1 
 
 
213 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  40.98 
 
 
215 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.9 
 
 
218 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.9 
 
 
218 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.9 
 
 
218 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.43 
 
 
218 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>