252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3768 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  61.35 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  61.06 
 
 		 192 aa  232  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  57.62 
 
 		 206 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  61.08 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  57 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  58.21 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  53.7 
 
 		 207 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  59.42 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  53.66 
 
 		 201 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  57 
 
 		 186 aa  204  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  58.45 
 
 		 193 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  60.39 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  60.2 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  55.5 
 
 		 190 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  60.87 
 
 		 189 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  59.2 
 
 		 186 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  52.4 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  58 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  58 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  58 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  52.97 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  52.74 
 
 		 194 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  51.52 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  45.93 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  43.04 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  47.5 
 
 		 191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  47.03 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  46.83 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  48 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  43 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  48.24 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  40.28 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  39.63 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  36.77 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.22 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  34.4 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  38.6 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.6 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.77 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  38.64 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.39 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.36 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  40.4 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.91 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  36.36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  37.04 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.36 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.78 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.36 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  36.07 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  36.77 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.08 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.84 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.33 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  36.99 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.33 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  37.86 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  32.88 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.77 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  34.4 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.22 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  38.14 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  47.32 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.89 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  37.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.44 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  34.8 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  35.48 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  38.17 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  35.48 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.94 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.32 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  36.89 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.98 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  35.87 
 
 		 237 aa  97.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.19 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.98 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.98 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  36.7 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  34.4 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.16 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  35.43 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  35.81 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  35.16 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>