264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10680 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 
211 aa  423  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  55.22 
 
 
192 aa  211  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  53.73 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  53.81 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  52.4 
 
 
209 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  55.78 
 
 
190 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  50.49 
 
 
206 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  49.27 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  50.99 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  53.09 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  48.77 
 
 
193 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  51.32 
 
 
186 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  50.77 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  54.21 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  54.21 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  53.68 
 
 
184 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  50.78 
 
 
190 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  53.06 
 
 
189 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  56.35 
 
 
189 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  52.24 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  49.54 
 
 
227 aa  171  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  51.26 
 
 
189 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  52 
 
 
190 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  43.93 
 
 
216 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  48.02 
 
 
193 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  48.45 
 
 
191 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  48.95 
 
 
194 aa  157  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  45.5 
 
 
194 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  42 
 
 
204 aa  152  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  48.42 
 
 
204 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  44.1 
 
 
207 aa  147  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  43.17 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  39.53 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.53 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  40.91 
 
 
199 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  41.43 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  41.03 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  39.9 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.57 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.1 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.67 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.57 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  38.57 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.57 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  38.57 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  37.38 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.57 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.57 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.03 
 
 
208 aa  111  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.1 
 
 
213 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  36.41 
 
 
210 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  39.5 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  37.74 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  38.46 
 
 
213 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.61 
 
 
212 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  38.32 
 
 
208 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
196 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  34.95 
 
 
201 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  38.83 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  42.42 
 
 
199 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 
215 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  35.68 
 
 
197 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 
215 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.91 
 
 
213 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  35.75 
 
 
221 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.05 
 
 
208 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 
215 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  37.09 
 
 
208 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.1 
 
 
207 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.2 
 
 
213 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  37.02 
 
 
200 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  37.38 
 
 
215 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  37.25 
 
 
210 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  37.29 
 
 
206 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  34.6 
 
 
208 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  40 
 
 
213 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.26 
 
 
209 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.8 
 
 
209 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.67 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
192 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.33 
 
 
208 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  33.33 
 
 
209 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  38.16 
 
 
208 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.67 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.67 
 
 
218 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  38.54 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.67 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  37.38 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.19 
 
 
218 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  35.12 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  33.49 
 
 
202 aa  98.2  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  35.81 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.65 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  40.11 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>