More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1968 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  100 
 
 		 215 aa  446  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  82.63 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  67.79 
 
 		 212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  65.88 
 
 		 213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  62.5 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  60.75 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  60.75 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  60.75 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  57.07 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  57.07 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  57.07 
 
 		 213 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  55.17 
 
 		 208 aa  244  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.59 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  56.59 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.59 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  56.59 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.59 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  57.07 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.8 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.31 
 
 		 218 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  55.83 
 
 		 213 aa  234  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.31 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.31 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  56.31 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  52.2 
 
 		 206 aa  222  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  50 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  49.07 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  46.67 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  47.8 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  45.24 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  45.63 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  45.05 
 
 		 197 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  47.26 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.5 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  46.08 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.28 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  44.81 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  48.89 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  44.66 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  45.6 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.5 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  43.56 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  42 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  47.54 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  43.28 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  42 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  43.28 
 
 		 201 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  45.3 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  46.41 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  44.12 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  44.12 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  39.05 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  44.68 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  43.63 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  40.98 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  38.57 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  45 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  44.39 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  45.25 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  38.46 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  44.75 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  44.13 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  44.13 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  40.67 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  40 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  45.51 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  45.56 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  39.91 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  40.2 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  41.57 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  41.83 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.73 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  40.45 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.98 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  38.39 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  41.34 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.22 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  41.67 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  39.8 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  40.21 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.67 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.67 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.67 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.11 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  37.5 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.11 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.11 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.11 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  41.76 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  41.01 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  37.26 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  38.89 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  40.56 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  41.53 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  37.69 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  39.5 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>