212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1717 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  61.66 
 
 
194 aa  234  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  56.44 
 
 
204 aa  217  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  57.77 
 
 
204 aa  216  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  56.31 
 
 
194 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  55.79 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  48.13 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  49.2 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  49.2 
 
 
186 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  44.97 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  47.62 
 
 
189 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 
190 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  51.87 
 
 
189 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  45.16 
 
 
193 aa  157  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 
216 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  46.83 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 
207 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  47.28 
 
 
201 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  45.08 
 
 
194 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  47.94 
 
 
195 aa  147  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  44.1 
 
 
211 aa  147  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  47.28 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  47.28 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  47.28 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 
184 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  44.68 
 
 
191 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  48.19 
 
 
190 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  49.47 
 
 
186 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  40.84 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  46.52 
 
 
189 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  39.11 
 
 
227 aa  122  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  40 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  45 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  35.79 
 
 
201 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  35.92 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  36.27 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
199 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.27 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  34.62 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  36.23 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  35.56 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  35.75 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  30.92 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  35.41 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 
196 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.98 
 
 
208 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  34.3 
 
 
208 aa  92  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  36.32 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  36.67 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  33.99 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  37.43 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  32.23 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  36.32 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  37 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.58 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.13 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.49 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.64 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.64 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  33.64 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  33.64 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.64 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.52 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.64 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  34.13 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.02 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.21 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.49 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  32.84 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.49 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.49 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.49 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.01 
 
 
218 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  29.86 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  32.18 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.4 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  35.44 
 
 
240 aa  77.8  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  33.64 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  31.46 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  32.38 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  37.02 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  31.68 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  30.97 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.78 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.78 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  32.97 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  30.27 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  31.32 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  33.16 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>