More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1739 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  64.95 
 
 		 201 aa  270  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  61.73 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  56.48 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  55.96 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  52.15 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  50.79 
 
 		 202 aa  194  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  49.1 
 
 		 192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  44.81 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  46.81 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  45.9 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.36 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.67 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.44 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.44 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.79 
 
 		 213 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.63 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.79 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  41.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  43.78 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.18 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.71 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  43.78 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  42.79 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  45.16 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  42.64 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  42.64 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.32 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.28 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.32 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.32 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.32 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  41.81 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.83 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.26 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.13 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  41.62 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.4 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  40.98 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  40.98 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  41.5 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  41.33 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  40.98 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  41.29 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.39 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  45.3 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  43.33 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  41.41 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  40.5 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  43.35 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  40.49 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  36.55 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  41.44 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  40.49 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.91 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.75 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  37.81 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.46 
 
 		 212 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.46 
 
 		 212 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.46 
 
 		 212 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  43.26 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  40 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  40.8 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.9 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.9 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.9 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.9 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  41.5 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  36.54 
 
 		 237 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  41.67 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  40.31 
 
 		 200 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  39 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  39.8 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  39.3 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  36.82 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  38.5 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  36 
 
 		 240 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  38.31 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  37.76 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  37 
 
 		 248 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  37.24 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  38.92 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.5 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  37.8 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  38.38 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  37.84 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>