More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1970 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  72.12 
 
 
213 aa  317  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  67.79 
 
 
215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  65.38 
 
 
215 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  65.2 
 
 
215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  65.2 
 
 
215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  63.46 
 
 
215 aa  284  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  63.16 
 
 
210 aa  279  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.58 
 
 
213 aa  251  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.27 
 
 
213 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.58 
 
 
213 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  59.8 
 
 
218 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  56.65 
 
 
208 aa  249  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  60.78 
 
 
213 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  59.8 
 
 
218 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.08 
 
 
213 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  61.08 
 
 
213 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.08 
 
 
213 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  59.8 
 
 
218 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  61.08 
 
 
213 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  59.8 
 
 
218 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.08 
 
 
213 aa  248  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  59.8 
 
 
218 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  60.29 
 
 
213 aa  245  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  52.76 
 
 
206 aa  216  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  51.98 
 
 
206 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  49.76 
 
 
208 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  50 
 
 
206 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  46.53 
 
 
197 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  48.53 
 
 
208 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  49.27 
 
 
209 aa  187  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  47.32 
 
 
200 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  47.37 
 
 
208 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  47.54 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  46.04 
 
 
201 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  48.76 
 
 
209 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  46.99 
 
 
199 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  46.34 
 
 
209 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  46.27 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  47.59 
 
 
203 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.78 
 
 
201 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  45.32 
 
 
198 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  44.67 
 
 
205 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  46.04 
 
 
206 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  44.28 
 
 
201 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  41.35 
 
 
206 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  49.18 
 
 
201 aa  165  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.37 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  45 
 
 
179 aa  162  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  43.69 
 
 
213 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  40.87 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  45.64 
 
 
213 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  42.36 
 
 
202 aa  158  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  41.71 
 
 
212 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  43.14 
 
 
238 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  47.25 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  46.71 
 
 
204 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  43.14 
 
 
201 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  48.04 
 
 
208 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  44.74 
 
 
196 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  41.58 
 
 
208 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  45.13 
 
 
225 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  43.69 
 
 
213 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  43.2 
 
 
213 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  41.67 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  40.95 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  41.09 
 
 
237 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 
196 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  40.59 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  43.59 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  44.69 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  40.49 
 
 
208 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  45.41 
 
 
213 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  45.05 
 
 
203 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 
202 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  37.79 
 
 
221 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  43 
 
 
188 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  40.59 
 
 
240 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
210 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  39.15 
 
 
210 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  44.69 
 
 
210 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  43.96 
 
 
210 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  44.69 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  43.48 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  43.58 
 
 
208 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  39.71 
 
 
198 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.51 
 
 
212 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  44.69 
 
 
210 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.51 
 
 
212 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.51 
 
 
212 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  44.13 
 
 
210 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.96 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.96 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.17 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  40.2 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  43.89 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.96 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.96 
 
 
212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  40.39 
 
 
193 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 
210 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>