232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2734 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  62.03 
 
 		 194 aa  242  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  65.38 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  58.38 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  51.98 
 
 		 204 aa  217  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  55.79 
 
 		 207 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  48.9 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 191 aa  167  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  47.87 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  49.19 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  47.8 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  47.8 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  48.45 
 
 		 211 aa  160  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  51.06 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  52.46 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  44.02 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  47.5 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  51.63 
 
 		 186 aa  154  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  48.35 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  48.35 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  48.35 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  39.7 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  49.16 
 
 		 184 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  42.73 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  47.53 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  45.86 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  39.29 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  37.89 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  38.99 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  45.6 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.47 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  35.64 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.15 
 
 		 213 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.14 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.14 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.14 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.14 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 		 218 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  33.83 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  35.75 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  36.36 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  33 
 
 		 201 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  36.95 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.69 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  38.86 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  36.23 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  34.57 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33 
 
 		 215 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  34.65 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  34.12 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.5 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.5 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  31.84 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.1 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.22 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  33.83 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  37.63 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  34.07 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  33 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  31.69 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  34.63 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  35.12 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  25.37 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  31.19 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.25 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.5 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.68 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  29 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.53 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.5 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  34.02 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  35.61 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  34.16 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  30.46 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  33.66 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  31.89 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  34.16 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>