268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0349 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  63.82 
 
 
208 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  54.94 
 
 
237 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  63.18 
 
 
210 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  61 
 
 
212 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  57.75 
 
 
214 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  56.6 
 
 
216 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  59.9 
 
 
213 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  60.71 
 
 
221 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  58.62 
 
 
208 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  62.25 
 
 
212 aa  254  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  59.41 
 
 
213 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  56.86 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  65.64 
 
 
210 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  60 
 
 
210 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  57.92 
 
 
240 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  59.39 
 
 
210 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  59 
 
 
210 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.98 
 
 
212 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.98 
 
 
212 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.98 
 
 
212 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  61.81 
 
 
210 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  59.5 
 
 
210 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  59.39 
 
 
210 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.49 
 
 
212 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.49 
 
 
212 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.49 
 
 
212 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.49 
 
 
212 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  59.79 
 
 
225 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  58.88 
 
 
210 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  55.45 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  60.41 
 
 
208 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  58.5 
 
 
203 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  59.5 
 
 
210 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  60.61 
 
 
203 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  61.34 
 
 
208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  58.85 
 
 
207 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  58.5 
 
 
200 aa  231  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  52.26 
 
 
202 aa  228  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  59.79 
 
 
207 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  57.79 
 
 
208 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  56.99 
 
 
199 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  52.82 
 
 
209 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  55.67 
 
 
201 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  56.48 
 
 
198 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  54.87 
 
 
197 aa  218  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  54.36 
 
 
201 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  55.44 
 
 
201 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  55.44 
 
 
201 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  53.85 
 
 
209 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  51.55 
 
 
209 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  54.64 
 
 
201 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  51.3 
 
 
205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1593  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 
210 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  45.89 
 
 
238 aa  191  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  45.59 
 
 
206 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  48.54 
 
 
221 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  41.58 
 
 
206 aa  175  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  41.58 
 
 
206 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  53.8 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  47.52 
 
 
216 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  50.98 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  53.8 
 
 
213 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  44.06 
 
 
206 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  51.26 
 
 
213 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  43.48 
 
 
208 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  44.32 
 
 
204 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  45.16 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  44.07 
 
 
179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  50.29 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  49.44 
 
 
206 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  46.77 
 
 
208 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  47.85 
 
 
208 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  42.03 
 
 
208 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  46.46 
 
 
208 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.16 
 
 
213 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  43.78 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.16 
 
 
213 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.16 
 
 
213 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.16 
 
 
213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.16 
 
 
213 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  42.16 
 
 
213 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  42.16 
 
 
213 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.16 
 
 
213 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.67 
 
 
213 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.1 
 
 
208 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.26 
 
 
213 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.52 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.52 
 
 
215 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.52 
 
 
215 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  40.38 
 
 
218 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.9 
 
 
218 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  40.95 
 
 
210 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.9 
 
 
218 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.9 
 
 
218 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  39.9 
 
 
218 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  34.5 
 
 
208 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.46 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33075  NAD(+) salvage pathway gene  37.56 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.34 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>