More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5120 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  81.43 
 
 		 210 aa  339  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  69.12 
 
 		 225 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  71.14 
 
 		 208 aa  287  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  72.91 
 
 		 208 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  72.96 
 
 		 210 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  67.16 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  72.45 
 
 		 210 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  66.67 
 
 		 210 aa  279  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  68.32 
 
 		 208 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  72.54 
 
 		 210 aa  277  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  69.15 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.64 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.64 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.64 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  72.02 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.14 
 
 		 212 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.14 
 
 		 212 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  71.43 
 
 		 210 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.14 
 
 		 212 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.14 
 
 		 212 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  62.02 
 
 		 237 aa  274  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  63.33 
 
 		 213 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  72.02 
 
 		 210 aa  274  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  64.29 
 
 		 213 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  72.22 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  70.15 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  65.22 
 
 		 208 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  65.64 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  65.15 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  64.8 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  64.29 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  62.31 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  66.15 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  59.31 
 
 		 240 aa  249  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  61.19 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  56.37 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  59.2 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  66.33 
 
 		 203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  60.91 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  56.54 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  61.14 
 
 		 199 aa  238  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  58.29 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  59.28 
 
 		 200 aa  228  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  57.87 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  56.7 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  57.65 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  57.65 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  58.76 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  53.33 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  57.59 
 
 		 198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  53.09 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  57.22 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  57.78 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  58.33 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1593  isochorismatase hydrolase  47.47 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  56.67 
 
 		 213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  53.07 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  56.11 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  52.76 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  54.04 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  48.44 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  53 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  47.5 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  47.13 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  47.7 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  46.86 
 
 		 179 aa  182  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  48.82 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  47.78 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  50.28 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  46.59 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  47.72 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  49.46 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  53.33 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  45.81 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  46.6 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.23 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.88 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.88 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.88 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.88 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.37 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  42.56 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.08 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.05 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.37 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  42.79 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.33 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  41.79 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.33 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  41 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.33 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.26 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>