264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1446 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  94.84 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  86.85 
 
 		 210 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  68.4 
 
 		 212 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  69.95 
 
 		 210 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  69.95 
 
 		 210 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  69.46 
 
 		 210 aa  291  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  69.46 
 
 		 210 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  68.97 
 
 		 210 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  64.79 
 
 		 221 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  68.97 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  65.05 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.61 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.61 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.61 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.14 
 
 		 212 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.14 
 
 		 212 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.14 
 
 		 212 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  67.14 
 
 		 212 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  68.12 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  68.93 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  64.25 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  61.95 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  64.73 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  64.53 
 
 		 210 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  63.33 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  59.72 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  65.7 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  61.31 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  59.61 
 
 		 216 aa  254  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  59.41 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  61.43 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  60.1 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  57.97 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  61.65 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  56.59 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  59.09 
 
 		 203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  57.43 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  58.21 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  62.44 
 
 		 203 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  58.16 
 
 		 199 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  58.38 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  58.91 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.76 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  57.58 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  57.58 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  55.45 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  56.7 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  57.73 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  53.81 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  56.12 
 
 		 197 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  56.19 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1593  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  51.79 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  47 
 
 		 238 aa  187  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  50 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  48.02 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  46.89 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  53.85 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  42.93 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  42.93 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  51.63 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  51.65 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  48.02 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  45.41 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  47.03 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  50 
 
 		 179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  50.27 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  47.18 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  45.89 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  47.18 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  47.18 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  46.89 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  45.89 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  45.64 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  45.86 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.49 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.59 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  48.02 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.08 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.08 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  43.08 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  47.03 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.43 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.95 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  42.56 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.56 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  44.68 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  44.62 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.1 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.1 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  45.21 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.1 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.1 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.1 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  40.59 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>