More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1368 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  99.5 
 
 
201 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  91 
 
 
201 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  69.19 
 
 
200 aa  276  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  66.67 
 
 
197 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  67.69 
 
 
203 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  65.64 
 
 
198 aa  261  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  64.29 
 
 
201 aa  260  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  64.8 
 
 
199 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  64.62 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  61.54 
 
 
210 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  61.54 
 
 
209 aa  244  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  56.85 
 
 
202 aa  244  9e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  63.64 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  62.05 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  59.39 
 
 
201 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  60.5 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  58 
 
 
208 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  58.29 
 
 
212 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  57.58 
 
 
213 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  59.8 
 
 
212 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  56.78 
 
 
240 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  56.57 
 
 
213 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  57.07 
 
 
208 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.79 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.79 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.79 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  57.81 
 
 
216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  55.84 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.29 
 
 
212 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.29 
 
 
212 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.29 
 
 
212 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.29 
 
 
212 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  56.48 
 
 
221 aa  218  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  57.29 
 
 
210 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  57.29 
 
 
210 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  57.29 
 
 
210 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  58.29 
 
 
210 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  57.29 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  57.07 
 
 
210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  55.44 
 
 
248 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  56.57 
 
 
210 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  57.73 
 
 
208 aa  214  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  57.14 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  56.57 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  58.03 
 
 
208 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  54.77 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  57.65 
 
 
210 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  58.03 
 
 
203 aa  208  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  53.33 
 
 
237 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  55.9 
 
 
225 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  55.56 
 
 
208 aa  201  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  49.23 
 
 
238 aa  195  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  49.49 
 
 
206 aa  191  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  49.74 
 
 
205 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  50.5 
 
 
213 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  51 
 
 
213 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  53.33 
 
 
213 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  51.98 
 
 
217 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.27 
 
 
213 aa  184  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  49.72 
 
 
179 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  46.23 
 
 
208 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  46.23 
 
 
208 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  46.73 
 
 
210 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  49.27 
 
 
208 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  43.75 
 
 
206 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  42.56 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  46.15 
 
 
206 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.78 
 
 
212 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  47.73 
 
 
204 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  46.19 
 
 
208 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  48.99 
 
 
208 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.5 
 
 
218 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  44 
 
 
218 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  44 
 
 
218 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  44 
 
 
218 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  52.54 
 
 
196 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  48 
 
 
215 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  44 
 
 
218 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.22 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  44.22 
 
 
215 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  45 
 
 
215 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  46.97 
 
 
208 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.41 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.41 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  41.41 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  41.41 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.41 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1593  isochorismatase hydrolase  44.33 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.41 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.41 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.41 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  46.5 
 
 
216 aa  161  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  40.91 
 
 
213 aa  160  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  45.05 
 
 
213 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  42 
 
 
215 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  41.21 
 
 
215 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  43.94 
 
 
206 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  46.53 
 
 
221 aa  154  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  39 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>