267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1958 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  64.32 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  67.78 
 
 		 190 aa  227  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  62.84 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  62.09 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  60.56 
 
 		 186 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  56.45 
 
 		 194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  59.68 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  57.98 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  62.98 
 
 		 184 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  62.98 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  62.98 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  53.66 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  58.79 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  59.78 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  58.6 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  59.46 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  54.89 
 
 		 193 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  65.22 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  55.38 
 
 		 193 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  58.24 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  61.67 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  53.09 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  54.14 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  46.31 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  44.34 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  52.43 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  45.41 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  47.22 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  42.86 
 
 		 227 aa  151  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  47.28 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  45.13 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.21 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  41.21 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  37.89 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  40.41 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.68 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.14 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  37.88 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  40.91 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.82 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  40 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  46.07 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  39.22 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  37.62 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  36.68 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  36.41 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  37.16 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  34.18 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  38.92 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  40.43 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  37.75 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  40.59 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  35.15 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  34.72 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.34 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  38.2 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  36.9 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  33.68 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  36.87 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  37.19 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.68 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  37.63 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.23 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  37.37 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  37.31 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.33 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.03 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.65 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.03 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.03 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.69 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.67 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  39.31 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.03 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  37.37 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  34.83 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  37.76 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  37.93 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  37.37 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.71 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  29.59 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  36.82 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  33 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  33 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  33 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>