204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0379 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  64.86 
 
 		 192 aa  238  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  62.16 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  65.57 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  65.17 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  63.49 
 
 		 206 aa  226  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  65.03 
 
 		 190 aa  225  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  68.48 
 
 		 189 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  62.09 
 
 		 201 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  58.21 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  61.58 
 
 		 184 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  61.58 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  61.58 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  57.84 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  57.22 
 
 		 189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  54.59 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  60.77 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  60.75 
 
 		 189 aa  190  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  61.24 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  54.59 
 
 		 193 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  50.77 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  45.71 
 
 		 216 aa  177  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  48.26 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  52.54 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  45.36 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  45.58 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  53.89 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  49.16 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  51.38 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  44.05 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  42.93 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  47.92 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.33 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  34 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  36.14 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.5 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.66 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  35.68 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  36 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 203 aa  98.2  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  34.69 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  31.28 
 
 		 208 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  35.11 
 
 		 206 aa  94.4  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.87 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  34.87 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  36.21 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.27 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  31.28 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  38.66 
 
 		 206 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  32.31 
 
 		 210 aa  91.3  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.48 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  30.15 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  37.42 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  34.85 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  34.2 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.83 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.83 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.83 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.16 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  33.85 
 
 		 208 aa  88.6  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.49 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  34.02 
 
 		 208 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.97 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.97 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.97 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  32.99 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  36.32 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  32.95 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.97 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  32.97 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.97 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  32.97 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.7 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.43 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.43 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.53 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.47 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.31 
 
 		 206 aa  84.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  33.33 
 
 		 221 aa  84.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.05 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  36.31 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  35.54 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  35.54 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  33.33 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  29.95 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  34.03 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  36.52 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  35.2 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  33.73 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>