More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08090 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 192 aa  396  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  48.73 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  46.43 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  48.85 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  43.96 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 		 192 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  48.85 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  43 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  45.66 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  45.31 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  45.4 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  42.63 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  44.05 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  40.31 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 207 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  43.17 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  44.27 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  35.71 
 
 		 227 aa  127  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  44.05 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  37.88 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  37.89 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  42.61 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  36.78 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  32.11 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  35.83 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  36.61 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.69 
 
 		 215 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.17 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  35.38 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.79 
 
 		 212 aa  87.8  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.17 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  32.37 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.72 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.42 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  32.29 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.21 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.98 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  31.53 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  32.66 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.18 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  35.98 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.21 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.18 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.9 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.21 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.21 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  34.21 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  34.21 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.55 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  29.7 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  34.55 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  32.35 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  31.77 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  31.02 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.1 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.03 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  31.88 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  31.43 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  32.26 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  30.89 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.11 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  34.22 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  31.94 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  32.62 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  31.91 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.55 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.26 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.18 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  30 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.18 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.18 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.18 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.38 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  33.82 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  28.77 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  32.63 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  33.51 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>