More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0859 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  100 
 
 
166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  58.13 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.71 
 
 
201 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  33.14 
 
 
201 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  34.64 
 
 
197 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  33.52 
 
 
201 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  33.7 
 
 
200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.96 
 
 
209 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  34.3 
 
 
201 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  35 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.46 
 
 
210 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.56 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  36.48 
 
 
206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.15 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.08 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 
213 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  30.39 
 
 
199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.71 
 
 
213 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.27 
 
 
213 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.71 
 
 
213 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  33.71 
 
 
213 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.71 
 
 
213 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  35.2 
 
 
210 aa  107  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.26 
 
 
216 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.31 
 
 
206 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.9 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.15 
 
 
213 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  31.49 
 
 
209 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  33.7 
 
 
208 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.15 
 
 
215 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 
215 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 
215 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  31.35 
 
 
214 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 
203 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  33.33 
 
 
206 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  33.72 
 
 
198 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  35.91 
 
 
202 aa  101  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  40.52 
 
 
192 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.96 
 
 
218 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.96 
 
 
218 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.96 
 
 
218 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.96 
 
 
218 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  29.89 
 
 
203 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.17 
 
 
213 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.96 
 
 
218 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  28.96 
 
 
213 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  29.67 
 
 
238 aa  98.6  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  30.05 
 
 
208 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  28.42 
 
 
213 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  34.27 
 
 
208 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  27.87 
 
 
213 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.65 
 
 
207 aa  97.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  28.09 
 
 
215 aa  97.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  32.22 
 
 
206 aa  97.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  28.34 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  30.51 
 
 
201 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
192 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  29.35 
 
 
248 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  34.68 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  28.42 
 
 
217 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  33.33 
 
 
221 aa  94  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  35.06 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  29.78 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.15 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  28.88 
 
 
207 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  30.73 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
203 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  33.53 
 
 
192 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
184 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  32.02 
 
 
213 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
184 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  31.46 
 
 
213 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 
190 aa  91.3  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.91 
 
 
208 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
211 aa  90.9  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  30.05 
 
 
237 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
201 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  28.42 
 
 
225 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 
196 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  28.98 
 
 
208 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.17 
 
 
208 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  30.34 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  30.34 
 
 
210 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  27.68 
 
 
216 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  29.41 
 
 
205 aa  88.6  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 
210 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  27.72 
 
 
210 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
191 aa  87.4  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  27.84 
 
 
212 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 
193 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.26 
 
 
212 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
221 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  28.65 
 
 
210 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  33.93 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>