270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1540 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.91 
 
 
213 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.26 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.26 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.71 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  35.71 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.22 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.71 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.22 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.22 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.22 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.22 
 
 
218 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.16 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.71 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.71 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.88 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  35.98 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.88 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.88 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.84 
 
 
163 aa  92.4  4e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.52 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.53 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.15 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
199 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.32 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.9 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.07 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1729  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362218  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000699  nicotinamidase  31.44 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.51 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  29.76 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06577  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.12 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  28.72 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  28.5 
 
 
238 aa  81.3  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  34.21 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5644  hypothetical protein  30.26 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  33.33 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  28.57 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  31.87 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  27.69 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  33.55 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64950  hypothetical protein  29.74 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  30 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  30.41 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  27.98 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.42 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  28.49 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  25.59 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  31.52 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  30.77 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  27.98 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  28.41 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  29.63 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  30.39 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  28.99 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  26.47 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  26.73 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  27.81 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  32.31 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2246  nicotinamidase  31.74 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.942136  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  26.34 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  29.32 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.32 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  31.79 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  27.46 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  26.94 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  28.96 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  27.87 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  27.47 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  26.78 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  28.36 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.77 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  26.07 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  27.05 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  27.47 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  26.15 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  26.88 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.74 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.34 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.34 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.34 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1412  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>