168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1729 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1729  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 215 aa  446  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64950  hypothetical protein  51.26 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5644  hypothetical protein  51.76 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1412  isochorismatase hydrolase  49.02 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2246  nicotinamidase  52.78 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.942136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06577  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.18 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000699  nicotinamidase  39.81 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.06 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.68 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.5 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.71 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  38.71 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  30.99 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.71 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.71 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.71 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.71 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.17 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.17 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  30.52 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.67 
 
 		 206 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.92 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.92 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.92 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.92 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  32.82 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.15 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.29 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  28.86 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  38.17 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  32.32 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  32.66 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  33.51 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  31.47 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  29.14 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  31.63 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.93 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.93 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  31.68 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  35.36 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  32 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  37.04 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  31.98 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.66 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.66 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.66 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  38.17 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.29 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  28.79 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  29.19 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  32.4 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  30.77 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  30.58 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  29.95 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  31.31 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.16 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.78 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  28.83 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  27.46 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.66 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  36.09 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  29.71 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.33 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  28.7 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  29.81 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  26.09 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  30 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  30.81 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.86 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  28.49 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  33.07 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  29.9 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  37.6 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  29.08 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.02 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  28.34 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  36.89 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  32.48 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  28.57 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>