167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_64950  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5644  hypothetical protein  98.17 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1412  isochorismatase hydrolase  77.78 
 
 
214 aa  339  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2246  nicotinamidase  70.67 
 
 
216 aa  288  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.942136  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1729  isochorismatase hydrolase  51.61 
 
 
215 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362218  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06577  pyrazinamidase/nicotinamidase  46.19 
 
 
230 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000699  nicotinamidase  44.1 
 
 
217 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  35.64 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  33.17 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  36.27 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  36.59 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  35.38 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  32.37 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  33.16 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  33.51 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  28.49 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  35.23 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.31 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  33.51 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  30.57 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  36.97 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.33 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  34.39 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  34.59 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  33.33 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  29.69 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  32.38 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  32.99 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  31.44 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  34.83 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  33.84 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  31.79 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  34.72 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.09 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.68 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.69 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  31.47 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  29.31 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  34.72 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  32 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  32.81 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  33.65 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  33.51 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  32.2 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  34.2 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  31.22 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  33.68 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  32.99 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.83 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.83 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.83 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  25.25 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  31.18 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  32.12 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  30.11 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.27 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.27 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.27 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.27 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  31.47 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  33.86 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  31.12 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  29.21 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  31.31 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.58 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.58 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.58 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  28.87 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.56 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  32.84 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  27.08 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  28.12 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  32.7 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  28.49 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  32.57 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.96 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 
184 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.72 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  29.15 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  33.61 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  28.64 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  30.1 
 
 
186 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  31.82 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 
201 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.21 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>