157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2246 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2246  nicotinamidase  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.942136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1412  isochorismatase hydrolase  69.86 
 
 		 214 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64950  hypothetical protein  70.67 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5644  hypothetical protein  70.19 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1729  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06577  pyrazinamidase/nicotinamidase  42.13 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000699  nicotinamidase  40.51 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  36.57 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  35.59 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.01 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  31.32 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  33.68 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.17 
 
 		 208 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  32.81 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  31.89 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  31.16 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  32.82 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.22 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  31.12 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  32.52 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.63 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  30.57 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  35.57 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  34.36 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  31.77 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  30.15 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  33.85 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.67 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  30.6 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  28.08 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  29 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  28.57 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.67 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  31.67 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.11 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  31.16 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  27.37 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.33 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  30 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.05 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  29.69 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  31.16 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  29.94 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  28.27 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.47 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.56 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.6 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.6 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.6 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.89 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.04 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.04 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.04 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.04 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  31.29 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  28.89 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  30.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.96 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  29.35 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  32.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  28.73 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  31.28 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  33.16 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.49 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.88 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  28.65 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  29.47 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  31.15 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  28.08 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.42 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  30.6 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  26.21 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  30.77 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  29.95 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  29.83 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.88 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.95 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.56 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.56 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.56 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.56 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.56 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  28.92 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  29.44 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.95 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.95 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  34.92 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  24.35 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  30.26 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  26.88 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>