250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07780 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  44.1 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 
203 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  38.68 
 
 
208 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.15 
 
 
208 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  40.53 
 
 
237 aa  138  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  40.32 
 
 
202 aa  135  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  41.18 
 
 
207 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  42.55 
 
 
210 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  41.83 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  38.65 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  41.4 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  38.12 
 
 
210 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  41.08 
 
 
212 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  42.02 
 
 
207 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  38.92 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  39.41 
 
 
225 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  40.4 
 
 
213 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33075  NAD(+) salvage pathway gene  33.94 
 
 
235 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  41.62 
 
 
208 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  38.62 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  37.61 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.29 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  39.68 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  38.17 
 
 
209 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  38.16 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  39.04 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  36.71 
 
 
217 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  38.22 
 
 
203 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  39.15 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  37.14 
 
 
215 aa  124  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  40.86 
 
 
210 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  41.4 
 
 
210 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  38.22 
 
 
213 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  37.06 
 
 
213 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  40.32 
 
 
210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  36.7 
 
 
206 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  40.32 
 
 
210 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  35.05 
 
 
213 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  37.23 
 
 
201 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  38.38 
 
 
210 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
206 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  38.42 
 
 
248 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  37.14 
 
 
206 aa  121  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  40 
 
 
212 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  38.22 
 
 
213 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  37.86 
 
 
208 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.46 
 
 
212 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  35.29 
 
 
201 aa  121  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1010  nicotinamidase  38.89 
 
 
204 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.4989  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  39.55 
 
 
238 aa  121  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  33.8 
 
 
208 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  36.63 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  39.78 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  36.14 
 
 
206 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.48 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  35.83 
 
 
179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  39.78 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  36.76 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.56 
 
 
209 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  35.98 
 
 
197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  38.25 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.93 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  34.93 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  34.8 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  34.15 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  35.6 
 
 
201 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  34.72 
 
 
221 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  32.89 
 
 
206 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  35.11 
 
 
198 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.11 
 
 
208 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  35.98 
 
 
198 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.08 
 
 
213 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.6 
 
 
213 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.6 
 
 
213 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.22 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.13 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.18 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
192 aa  98.6  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.7 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.7 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.7 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.7 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.77 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  32.82 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.68 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>