144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06577 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06577  pyrazinamidase/nicotinamidase  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000699  nicotinamidase  83.87 
 
 		 217 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1412  isochorismatase hydrolase  47.76 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5644  hypothetical protein  46.7 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64950  hypothetical protein  46.19 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1729  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2246  nicotinamidase  46.29 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.942136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  34.62 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.31 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.82 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  33.82 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.23 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  32.69 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  32.4 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.25 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.14 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  29.85 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.24 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.68 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  35.04 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  35.37 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  29.9 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  36.36 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.43 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  32.04 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  27.75 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  35 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  31.43 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  30.85 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  30.05 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  33.85 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.03 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  31.03 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.03 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  30.85 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.03 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.46 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.03 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.03 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  26.95 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  32.43 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  35.2 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  33.08 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.53 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  33.57 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  27.27 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  31.79 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  28.77 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  28.14 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.67 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.46 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.93 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.32 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.93 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.93 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3153  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  30.06 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.12 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.93 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  29.03 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  27.5 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  30.91 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  29.88 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  31.79 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  29.07 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.5 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  27 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0349  nicotinamidase  30.19 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5120  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  31.93 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  28.5 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.91 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.91 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  30.32 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.91 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.82 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.25 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  31.52 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.23 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  34.29 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  27.44 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  27.71 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.75 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  28.65 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  30.72 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  30.3 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  26.22 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2683  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase  26.09 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.552581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>