276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1692 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  52.11 
 
 
203 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 
195 aa  177  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  36.71 
 
 
208 aa  131  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  41.06 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  41.36 
 
 
201 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  38.42 
 
 
198 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
196 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  41.55 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.05 
 
 
215 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.05 
 
 
215 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.24 
 
 
210 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  38.73 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  41.88 
 
 
192 aa  115  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.75 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  40 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 
199 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  41.18 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  39.81 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.83 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  37.56 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 
215 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 
215 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
202 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.29 
 
 
215 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.78 
 
 
213 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.2 
 
 
209 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 
210 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.98 
 
 
213 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 
193 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.8 
 
 
209 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.48 
 
 
213 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
210 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.48 
 
 
213 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.48 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  34.48 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.99 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  34.48 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.48 
 
 
213 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  37.56 
 
 
200 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  38.68 
 
 
208 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.99 
 
 
213 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  38.14 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  36.89 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  37.32 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  33.33 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  33.17 
 
 
197 aa  95.1  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  35.48 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.5 
 
 
213 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.99 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  36.02 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.8 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  37.09 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  34.62 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  37.5 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  36.97 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  35.89 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  34.8 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  35.6 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  34.3 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  34.95 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  34.87 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
189 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  39.34 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  34.3 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  38.8 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  38.8 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  36.51 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.95 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E15  pyrazinamidase/nicotinamidase, PncA protein  30.18 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  35.9 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  31.71 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  31.92 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 
218 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  37.8 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  34.63 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  35.71 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  33.65 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.86 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.02 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  33.8 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  34.3 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  38.02 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>