290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5162 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  72.16 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1692  isochorismatase hydrolase  52.11 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105025  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  44.5 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.64 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  40.64 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  42.65 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  41.67 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.89 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  40.87 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.27 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.41 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.41 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  38.34 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  39.22 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  38.54 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  37.93 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  39.47 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.41 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.78 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  38.73 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.24 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  40.78 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.18 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.24 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.24 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.76 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.24 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  35.24 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  39.69 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  38.39 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.24 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  35.24 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.98 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  33.33 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.75 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  36.89 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.76 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  36.1 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  42.41 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.44 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  34.48 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  37.75 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  37.75 
 
 		 238 aa  97.8  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1487  Nicotinamidase  38.12 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0102489  normal  0.0234233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  34.48 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  37.75 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  35.47 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  38.12 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  39.13 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  36.7 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  39.8 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  37.07 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  38.46 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  37.14 
 
 		 179 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  37.8 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  34.56 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  41.41 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  38.59 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  35.41 
 
 		 214 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  36.32 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  40.11 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  35.78 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.57 
 
 		 190 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  38.5 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  40.49 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  33.5 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.54 
 
 		 166 aa  92.4  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  40.72 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 		 218 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  36.06 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  92  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 		 218 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 		 218 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 		 218 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1905  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5206  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704992  normal  0.539889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6174  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  36.27 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.81 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  37.93 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  37.31 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  38.31 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.99 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.78 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.38 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>