More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0073 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  55.29 
 
 
174 aa  210  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  55.62 
 
 
174 aa  209  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  54.71 
 
 
174 aa  210  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 
185 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
176 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  41.33 
 
 
196 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  49.62 
 
 
203 aa  120  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 
199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  46.21 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 
201 aa  117  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 
201 aa  117  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 
214 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 
201 aa  111  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 
201 aa  111  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  37.28 
 
 
180 aa  104  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 
192 aa  101  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 
203 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  33.89 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  33.89 
 
 
182 aa  99  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
182 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  33.33 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
182 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
193 aa  97.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
193 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  34.29 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.48 
 
 
198 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  36.03 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  34.15 
 
 
199 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
192 aa  88.2  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  29.28 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 
192 aa  87.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.03 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.94 
 
 
183 aa  87  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  32.04 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  32.39 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.56 
 
 
201 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.56 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  26.49 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.35 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.85 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  29.28 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  24.21 
 
 
211 aa  80.9  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  34.73 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.92 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  27.37 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  34.73 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  29.76 
 
 
208 aa  79  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  32.08 
 
 
201 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  30 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  29.61 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1760  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase hydrolase  28.33 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130919  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  29.21 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0555  isochorismatase family protein  32.92 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  34.13 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  34.13 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  34.13 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  34.13 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  28.89 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  27.78 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  35.5 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  27.47 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.53 
 
 
213 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  30.56 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  37.76 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1461  putative nicotinamidase/pyrazinamidase  27.17 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  26.92 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  32.3 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  34.91 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  30 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  33.53 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  28.33 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  26.7 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.36 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  30.12 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1446  Nicotinamidase  28.33 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  0.0104691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.02 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0207  conserved hypothetical protein, putative amidase  33.33 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>